男子自身免疫反应的结果，一方面是细胞免疫导致睾丸炎，引起无精子或少精子症。另一方面产生精子凝集与精子制动抗体，分布在血浆及精浆中，降低了精子的存活率及活动力，在很大程度上降低了精液的质量，抑制精子附着及穿透卵子透明带，阻止精卵结合。另外，抗精子抗体可作用于胚胎使其被吸收或造成流产，并从多方面干扰受精过程而导致不育。

　　女子宫颈粘液中存在抗精子抗体时，通过使精子凝集而阻碍其穿过粘液，损伤精子，增强巨噬细胞吞噬精子的功能，使精子不能进入输卵管而导致不孕。这是由于性交时，精液通过受损的生殖器官进入女方体内引起的同种异体免疫反应造成的。